复旦大学国际问题研究成立于2000年。2013年起，复旦大学开始整合全校力量资源，瞄准国家战略和外交决策需求，努力把国际问题研究院建设成为中国国际关系与国际问题研究的新高地和具有国际影响的世界一流智库。
目前，研究院共有专职研究人员34人，其中教授15人，副教授14人，讲师和助理研究员5人。下设美国研究中心、日本研究中心、朝鲜韩国研究中心、俄罗斯中亚研究中心\上海合作组织研究中心、南亚\巴基斯坦研究中心、联合国与国际组织研究中心、中国外交研究中心、拉美研究室、中欧关系研究中心、中国发展模式研究中心、中国与周边国家关系研究中心、全球分析中心、全球贸易与投资中心、亚太区域合作与治理研究中心、法国研究中心等一批研究机构。
2013年底，我院获聘外交部政策研究重点合作单位(2013-2015年)，以此为契机，为国家外交决策提供更好的决策服务和智力支持。
研究院现任院长为复旦大学副校长林尚立教授(兼)，常务副院长为吴心伯教授。我国著名外交官、前联合国副秘书长沙祖康担任研究院名誉院长、院发展委员会主任。
